曼彻斯特位于一块盆地，北面和东面毗邻奔甯荒野，南面是柴郡平原。市中心位于艾威尔河(River Irwell)东岸，靠近另外两条河——麦诺克河（River Medlock）和River Irk的汇流处。默西河(River Mersey)也经过城市南部。内城区大部分是楼房，从许多高大建筑物楼上可以看到广阔的荒野。另外，曼彻斯特河道发达，靠近利物浦港口和煤矿。

曼彻斯特气候潮湿，属于终年温和多雨的温带海洋性气候，该市的平均年降水量为809毫米，降水持续时间长，降水强度小，常在1个小时以上，而鲜见几分钟的倾盘大雨。有时被称为雨城。在冬季是全国积最少雪的城市。